계약금에서 3.3%가 빠지고, 5월에 다시 정산된다

프리랜서(사업소득자)가 클라이언트로부터 대가를 받을 때는, 클라이언트가 지급액에서 원천징수세 3.3%를 미리 떼고 나머지만 지급하는 것이 원칙입니다. 이 3.3%는 소득세 3% + 지방소득세 0.3%로 구성되며, 근로소득자의 4대보험·소득세 공제처럼 클라이언트가 대신 국세청에 미리 납부해 두는 개념입니다. 예를 들어 1,000,000원짜리 계약이라면, 소득세 30,000원 + 지방소득세 3,000원 = 33,000원이 미리 빠지고, 실제 통장에는 967,000원만 들어옵니다.

클라이언트는 원천징수한 금액에 대해 원천징수영수증(지급명세서)을 국세청에 제출하고, 요청 시 프리랜서 본인에게도 발급해야 합니다. 이 서류에는 지급액·원천징수세액이 기록되어 있어, 나중에 종합소득세를 신고할 때 기납부세액을 확인하는 근거 자료가 됩니다. 여러 클라이언트와 거래했다면 각 클라이언트가 제출한 지급명세서 합계가 국세청 홈택스의 "지급명세서 등 제출내역"에서 조회되므로, 신고 전에 누락된 곳은 없는지 미리 확인해 두는 것이 안전합니다.

프리랜서는 매년 5월에 지난해 사업소득 전체를 합산해 종합소득세를 신고합니다. 이때 실제로 내야 할 세액은 총수입에서 필요경비를 뺀 소득금액을 기준으로 다시 계산되는데, 3.3%로 미리 뗀 금액은 이 최종 세액과 정확히 일치하지 않는 경우가 많습니다. 미리 뗀 금액이 실제 낼 세액보다 많으면 차액을 돌려받고(환급), 반대로 적으면 차액을 추가로 냅니다(추납). 특히 경비가 많거나 소득 구간이 낮은 프리랜서는 원천징수 3.3%가 실제 부담해야 할 세율보다 높게 책정된 경우가 많아 환급으로 이어지는 경우가 흔합니다.

종합소득세를 계산할 때는 수입에서 필요경비를 뺀 금액이 과세 대상 소득이 됩니다. 영수증·세금계산서 등 증빙을 모아 실제 지출한 경비를 그대로 인정받는 방법도 있지만, 증빙을 다 챙기지 못한 소규모 프리랜서를 위해 국세청이 업종별로 정한 비율만큼을 경비로 인정해 주는 단순경비율·기준경비율 제도도 있습니다. 단순경비율은 증빙 없이도 업종별 정해진 비율을 그대로 적용받는 대신 대상 요건(주로 신규 사업자나 낮은 수입 구간)이 있고, 기준경비율은 인건비·임차료 등 주요경비는 증빙으로, 나머지는 정률로 인정받는 방식입니다. 어느 쪽이 유리한지는 실제 지출 규모와 업종에 따라 달라 개별적으로 비교해 볼 필요가 있습니다.

사업소득 프리랜서라도 거래 형태에 따라 세금계산서를 발행하는 경우와 3.3% 원천징수만 적용되는 경우가 나뉠 수 있습니다. 세금계산서는 부가가치세가 얹어지는 거래에서 공급자가 발행하는 것으로, 별도 사업자등록과 부가세 신고 의무가 뒤따릅니다. 반면 프리랜서 인적용역처럼 부가세가 면제되는 사업소득은 세금계산서 대신 원천징수영수증으로 거래를 증빙하며, 부가세 신고 대신 다음 해 5월 종합소득세 신고로 마무리됩니다. 본인의 거래가 어느 쪽에 해당하는지는 계약 시점에 클라이언트와 명확히 확인해 두는 것이 좋습니다.

실제로 얼마나 환급받을 수 있을지 미리 가늠해 보려면 프리랜서 3.3% 환급 계산기를, 5월 종합소득세 전체 세액을 소득 구간별로 확인하려면 종합소득세 계산기를 이용해 보세요. 이 가이드는 2026년 7월 19일 시점 자료를 바탕으로 작성했으며, 경비율 고시나 세율 등 세부 규정은 매년 바뀔 수 있으니 정확한 신고는 홈택스 안내와 세무사 상담을 통해 진행하시길 권합니다.